Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabrb3P63080 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms