Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crabp1P62965 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crabp1P62965 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms