Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lmo4P61969 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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