Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms