Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg6P61406 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg6P61406 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Smg6P61406 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Smg6P61406 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms