Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp1P60335 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms