Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms