Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd4P58467 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Setd4P58467 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Setd4P58467 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms