Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NcstnP57716 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NcstnP57716 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NcstnP57716 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms