Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bace1P56818 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms