Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdaP56389 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdaP56389 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdaP56389 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdaP56389 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms