Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp1P56183 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms