Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd3P55096 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms