Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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RabggtbP53612 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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RabggtbP53612 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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RabggtbP53612 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms