Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Efnb1P52795 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Efnb1P52795 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Efnb1P52795 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Efnb1P52795 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Efnb1P52795 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Efnb1P52795 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Efnb1P52795 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Efnb1P52795 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Efnb1P52795 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Efnb1P52795 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Efnb1P52795 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Efnb1P52795 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Efnb1P52795 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Efnb1P52795 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Efnb1P52795 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Efnb1P52795 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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