Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fgd1P52734 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms