Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec1P51908 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms