Protein–RNA interactions for Protein: P51859

Hdgf, Hepatoma-derived growth factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdgfP51859 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HdgfP51859 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HdgfP51859 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HdgfP51859 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HdgfP51859 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms