Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr5P51682 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms