Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CntfP51642 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CntfP51642 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CntfP51642 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms