Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FmodP50608 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FmodP50608 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FmodP50608 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms