Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa1P49312 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hnrnpa1P49312 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms