Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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