Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms