Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr7P47774 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr7P47774 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms