Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms