Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NodalP43021 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NodalP43021 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NodalP43021 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NodalP43021 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NodalP43021 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NodalP43021 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NodalP43021 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NodalP43021 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NodalP43021 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NodalP43021 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NodalP43021 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NodalP43021 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NodalP43021 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NodalP43021 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NodalP43021 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NodalP43021 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NodalP43021 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NodalP43021 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NodalP43021 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NodalP43021 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NodalP43021 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NodalP43021 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NodalP43021 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NodalP43021 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NodalP43021 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NodalP43021 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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