Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms