Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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