Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd1P40201 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chd1P40201 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chd1P40201 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd1P40201 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd1P40201 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms