Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtlP38585 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtlP38585 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtlP38585 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtlP38585 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtlP38585 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtlP38585 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtlP38585 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtlP38585 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtlP38585 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtlP38585 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtlP38585 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtlP38585 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtlP38585 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtlP38585 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtlP38585 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtlP38585 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtlP38585 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtlP38585 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtlP38585 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtlP38585 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtlP38585 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtlP38585 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtlP38585 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtlP38585 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms