Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lig1P37913 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lig1P37913 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lig1P37913 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms