Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprkP35822 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprkP35822 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprkP35822 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprkP35822 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprkP35822 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprkP35822 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprkP35822 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprkP35822 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprkP35822 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms