Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ddit3P35639 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms