Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms