Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab20P35295 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab20P35295 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab20P35295 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms