Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms