Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola1P33609 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola1P33609 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola1P33609 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola1P33609 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola1P33609 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola1P33609 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola1P33609 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms