Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VtnP29788 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VtnP29788 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VtnP29788 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms