Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RxraP28700 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RxraP28700 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RxraP28700 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RxraP28700 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxraP28700 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RxraP28700 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxraP28700 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RxraP28700 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxraP28700 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxraP28700 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RxraP28700 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RxraP28700 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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