Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms