Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChgaP26339 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChgaP26339 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms