Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms