Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mdm2P23804 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm2P23804 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms