Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk1P22518 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms