Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb2P21619 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb2P21619 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms