Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a2P20490 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms