Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms