Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms