Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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PtpraP18052 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpraP18052 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpraP18052 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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